生物安全實驗室的建設方案包括：建筑布局和裝修、空氣調節(jié)、給排水、氣體供應、電氣設計、集中控制、安防、施工工藝、檢測、培訓等多方面內容，特別是對該方案的以下幾個方面要做極為充分考慮。
建筑布局和裝修方案
是潔凈實驗室-生物安全實驗室安全運行的基礎。由于微生物病菌的危險性，必須防止危險性微生物向外界擴散，全面地阻斷危險性微生物與外部環(huán)境的接觸途徑，同時避免微生物受外界污染，影響實驗結果的準確性，必須采取合理的實驗室布局和裝修方案。實驗室布局按照安全要求合理地劃分成清潔區(qū)、半污染區(qū)和污染區(qū)，采用人與物分別設置專用通道，設置必要的緩沖間，采用一次隔離和二次隔離等措施，能有效的避免交叉污染，從根本上防止危險性微生物的擴散；實驗室裝修采用可靠的材料，合理的施工措施，保證潔凈實驗室-生物安全實驗室始終處于相對密封的環(huán)境，防止微生物的外逸，易于實驗室的清潔消毒，同時避免外部對實驗室環(huán)境的破壞。
空氣調節(jié)系統(tǒng)
是潔凈實驗室-生物安全實驗室安全運行的關鍵。由于潔凈實驗室-生物安全實驗室內操作對象是危險性的微生物，對人體、動植物或環(huán)境具有危害，必須通過采用合理的空氣調節(jié)系統(tǒng)，保持潔凈實驗室-生物安全實驗室的相對負壓環(huán)境無論何時都不被破壞，以保證實驗室內危險性微生物不能向外部環(huán)境中擴散?？諝庹{節(jié)系統(tǒng)必須可靠運行，采用先進技術，合理利用和節(jié)約能源與資源，保證環(huán)境的質量和安全，為實驗人員提供所需要的溫度和濕度，保障生物實驗在安全的條件下進行，以確保實驗結果得準確性。同時它還必須控制實驗室的潔凈度，對新風進行過濾，使實驗室達到一定的凈化要求。其中排風系統(tǒng)是重點，對于保證實驗室相對負壓環(huán)境和有效過濾室內污染排風起著重要的作用。
控制系統(tǒng)
是整個潔凈實驗室-生物安全實驗室安全運行的神經中樞。由于潔凈實驗室-生物安全實驗室的實驗對象是危險性的微生物，出于嚴格控制污染的原則，它要求以最少的維護人員，運用最優(yōu)化的管理維護手段，來實時監(jiān)控每一個實驗室中設備所處的物理環(huán)境，保證實驗室運行過程中始終處于相對負壓環(huán)境，防止危險性微生物外泄。
檢測方案
是潔凈實驗室-生物安全實驗室長期安全運行的保證。由于潔凈實驗室-生物安全實驗室的特殊性，除了進行嚴格的設計、施工、調試外，為確保其安全性，必須對其進行必要的工程檢測和嚴格的驗收，達到安全要求和使用要求后才可投入運行。另外，使用過程中的一些因素，如非專業(yè)的管理和使用，高效過濾器的更換等，都會對實驗室的安全性產生影響，因此，使用中的定期檢測與同樣重要。
培訓方案
由于潔凈實驗室-生物安全實驗室中的實驗人員通常都是醫(yī)學專家，對于實驗室整個系統(tǒng)原理不一定十分了解，通過培訓方案，讓所有實驗室工作人員了解整個系統(tǒng)的特點，掌握其運行規(guī)律，可以及時發(fā)現安全隱患，并及時做出相應的應急處置，控制住事態(tài)的進一步惡化，對減輕后續(xù)維修工作的難度是有很大幫助的。