數(shù)字化實驗室主要通過實驗室數(shù)據(jù)的數(shù)字化、儀器設備與IT系統(tǒng)的聯(lián)網來實現(xiàn)。實現(xiàn)實驗室數(shù)據(jù)的數(shù)字化是實驗室日常工作中一個嚴峻挑戰(zhàn)。目前已經有許多不同類型的電子實驗室記錄(ELNs)和實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS)可供使用，但不是所有的實驗室都使用統(tǒng)一的系統(tǒng)管理數(shù)字化文件。某些移動輸入設備，例如，平板電腦和智能手機的發(fā)展都有利于數(shù)字化系統(tǒng)的應用和推廣。許多實驗室都會使用數(shù)據(jù)格式完全不同的數(shù)據(jù)，例如，Word、Excel、PDF和圖像格式的通用數(shù)據(jù)格式，也常常要用到一些特殊格式的數(shù)據(jù)。 一、實驗室數(shù)據(jù)的數(shù)字化為了能夠在更大范圍內使用這些數(shù)據(jù)，根據(jù)數(shù)據(jù)產生的過程來管理組織數(shù)據(jù)很有必要。圖像數(shù)據(jù)和其他格式的數(shù)據(jù)相互比較，無需把所有的圖譜并排進行對比，只把具有可比性的譜圖文件相互比較就可以了，要利用大數(shù)據(jù)首先要解決小數(shù)據(jù)的問題，但大多數(shù)實驗室都存在的難題是小數(shù)據(jù)太多卻難以關聯(lián)。在利用大數(shù)據(jù)的過程中，首先要制定標準，利用制定的標準可以把實驗過程中的數(shù)據(jù)輕松的匯總到一起，進行整理分類，實現(xiàn)相互比較。但迄今為止還沒有能夠將跨學科實驗室數(shù)據(jù)進行格式的統(tǒng)一。二、儀器設備與IT系統(tǒng)的聯(lián)網實驗設備和檢測儀器都算是實驗室的數(shù)據(jù)采集設備，它們可以記錄、生成大量數(shù)據(jù)。這些數(shù)據(jù)常常都被保存在聯(lián)網的計算機中，沒有聯(lián)網接口的話，可以保存在網絡驅動器中。因不同工作組之間面臨分散式的設備配置帶來的問題，因此限制了數(shù)據(jù)暢通無阻的傳輸，即使使用U盤也很難自動把儀器的結果數(shù)據(jù)與實驗室報告文檔數(shù)據(jù)建立起一一對應的聯(lián)系。為了填補實驗室儀器設備與IT系統(tǒng)間的空白，儀器設備制造商、實驗室用品生產廠、科研機構和制藥企業(yè)合作成立了一個名為“SiLA快速集成”的國際性組織，制定了實驗室儀器設備控制的統(tǒng)一標準。這一標準的目的是不同生產廠家生產的設備有著統(tǒng)一的接口，即所謂的PMS過程管理系統(tǒng)接口。這一PMS過程管理系統(tǒng)接口可以通過網絡服務器或者經互聯(lián)網的安全連接來登錄、訪問。這樣一來，同一實驗室的工作者就可以在不同的計算機上通過登錄訪問網絡，登錄的計算機可以是在同一大樓內的不同計算機，也可以是另一個地區(qū)的任一計算機，登錄后可以任意訪問一臺儀器設備，進行過程參數(shù)的輸入，同時接收設備數(shù)據(jù)。在自動化控制環(huán)境中，還可以對整個檢測過程或文件錄入過程進行遠程遙控或監(jiān)控。
SiLA實驗室的自動化標準中有用以集成各儀器設備的不同途徑。例如，通過與SiLA實驗室自動化兼容的驅動器，它能把不符合標準規(guī)定的設備通訊納入到網絡服務器的管理之中。SiLA接口轉換器能夠為儀器操作提供一個兼容的平臺，經網絡服務器與過程管理系統(tǒng)建立通訊。在方案里，SILA兼容平臺通過網絡服務器把第三方與過程管理系統(tǒng)連接起來，有助于各種設備的兼容，并能把實驗室中已經安裝的儀器設備與實驗室中的IT網系統(tǒng)連接起來。
很多成功的案例都表明可以實現(xiàn)實驗室各儀器設備間的連接，然而，數(shù)字化試驗記錄、實驗室管理系統(tǒng)LIMS之間的連接，但這種連接常常是復雜的，且成本高。在未來，或許實驗室儀器設備可以實現(xiàn)即開即用的連接。把數(shù)字化實驗記錄集成到與實驗室自動化標準SiLA兼容的過程管理系統(tǒng)中，正如弗勞恩霍夫研究所協(xié)會與Labfolder公司合作開發(fā)的方案那樣，可以極大地簡化大量實驗室儀器設備的常規(guī)連接。下一個必要的方案就是制定統(tǒng)一的連接協(xié)議標準，有了標準才能將在儀器設備上檢測的數(shù)據(jù)和填寫的數(shù)字化實驗記錄之間建立起相互關聯(lián)。這一標準的目的是建立一個基礎平臺，并能夠最大限度地看清基礎平臺中保存的數(shù)據(jù)。當過去的數(shù)據(jù)自動地應用在新過程優(yōu)化中時，集成、靈活的實驗室在使用過程中變得易如反掌了，這才可以說是真正實現(xiàn)了大數(shù)據(jù)應用。
