空氣凈化一方面是送入潔凈空氣對室內(nèi)污染空氣進行稀釋，另一方面是迅速排出室內(nèi)濃度高的污染空氣。為保證生產(chǎn)環(huán)境或其他用途的潔凈室所要求的空氣潔凈度，需要采取多方面的綜合措施，一般包括以下幾個方面：
(1)控制污染源，減少污染發(fā)生量這主要涉及發(fā)生污染的設(shè)備的設(shè)置與管理，以及進入潔凈室的人與物的凈化。盡量采用產(chǎn)生污染物質(zhì)少的工藝及設(shè)備，或采取必要的隔離和負(fù)壓措施，防止生產(chǎn)工藝產(chǎn)生的污染物質(zhì)向周圍擴散；減少人員及物料帶入室內(nèi)的污染物質(zhì)。例如，固體制劑的許多工藝中，粉體在干燥狀態(tài)下進行處理，必然會產(chǎn)生粉坐，為防止其擴散和污染空氣，產(chǎn)塵部位常果用局部排風(fēng)排施。對于某些生產(chǎn)工藝，例如藥廠生產(chǎn)工藝過程中散發(fā)的乙醇、甲醇、乙醚等蒸氣或氣體，主要是采取送風(fēng)、排風(fēng)配合使其稀釋到允許濃度以下，以防止爆炸等情況發(fā)生，一般不另采取凈化指施。
(2)有效地阻止室外的污染物侵入室內(nèi)(有數(shù)地防止室內(nèi)的污染物逸至室外)這是潔凈室控制污染的最主要途徑，主要涉及空氣凈化處理的方法、室內(nèi)的壓力控制等。對于空調(diào)送風(fēng)采用三級過濾措施：通過粗、中、高效三級過濾，層層攔截，將塵粒阻擋在高效過濾器之前，將潔凈空氣送入室內(nèi)。根據(jù)房間的潔凈度要求，用不同方式送人經(jīng)過特定處理的、數(shù)量不等的清潔空氣，同時排走相應(yīng)量的攜帶有室內(nèi)污染物質(zhì)的空氣，靠這樣一種動態(tài)平衡，使室內(nèi)空氣維持在要求的潔凈度水平。由此可見，對送入空氣的凈化處理是十分關(guān)鍵的一環(huán)，這就是潔凈室換氣次數(shù)大大超過一般空調(diào)房間的原因。潔凈度級別越高，其換氣次數(shù)越多。例如潔凈度級別為7級的潔凈室要求每小時換氣次數(shù)不少于15次，潔凈度級別為6級的潔凈室要求每小時換氣次數(shù)不少于50次。對于室內(nèi)正壓的控制，工業(yè)潔凈室和一般生物潔凈室采用正壓措施。在一個大的空間，要絕對封閉是不可能的。為此，在空調(diào)設(shè)計中均采取潔凈室的靜壓高于周圍環(huán)境一定值的措施。這樣在使用潔凈空調(diào)時，只允許室內(nèi)潔凈空氣往外漏，而避免室外空氣往里滲，即防止室外或鄰室的空氣攜帶污染物質(zhì)通過門窗或縫隙、孔洞侵入造成污染。
(3)迅速有效地排除室內(nèi)已經(jīng)發(fā)生的污染這主要涉及室內(nèi)的氣流組織，也是體現(xiàn)潔凈室功能的關(guān)鍵。合理的氣流組織，即通過送風(fēng)口與回風(fēng)口位置、大小、形式的精心設(shè)計，使室內(nèi)氣流沿一定方向流動，防止死角及造成二次污染。不同的氣流組織直接影響施工的難易程度及工程造價。一般潔凈度級別高于5級的潔凈室均采用單向流，其中以垂直單向流效果最好，但造價也最高。潔凈度級別為6~9級的潔凈室則采用非單向流的氣流組織。
(4)流速控制潔凈室內(nèi)空氣的流動要有一定速度，才能防止其他因素(如熱流)的擾亂。但又不能太大，流速太大將使室內(nèi)積塵飛揚，造成污染。
(5)系統(tǒng)的氣密性不僅通風(fēng)系統(tǒng)本身要求氣密性好，對建筑各部結(jié)合處、水暖電工藝管穿越圍護結(jié)構(gòu)處也應(yīng)堵嚴(yán)，防止?jié)B漏。一般看得見的縫隙、裂縫均無法阻止0.5μm粒徑的粉塵通過。
(6)建筑上的措施涉及建筑物周圍環(huán)境的設(shè)計、建筑構(gòu)造、材料選擇、平面布局、氣密性措施等設(shè)計。例如，采用產(chǎn)塵少、不易滋生微生物的室內(nèi)裝修材料及家具。